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Nat Biotechnol :深度解读!科学家成功清楚地绘制出新人类肠道的微生态系统目录!

2021-11-15 18:07:38 来源:
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近日,一项刊登在国际华尔街日报Nature Biotechnology上篇文章“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的学术研究报告中都,来自欧洲免疫学麻省理工学院等政府机构的科学界们通过学术研究将进化胃化学物质三组中都所有已知的病原体氨基酸概要已成了一个大型的采样库,从而就能尽力学术研究技术人员系统地即使病原体基因和蛋白质之间的相关联,以及其对进化健康的影响。

病原体遍布体液内另有,其都能产生蛋白质质来影响RX-消化、健康和对营养不良的易感性,其如此尤其以至于体液化学物质三组已成员的数量要比体液细胞还要多,有数病原体、变形虫和其它化学物质;为了解读病原体在进化遗传学中都所担纲的关键因素配角,科学界们通常时会在麻省理工学院中都复合并对其培育,随后在对病原体进行时DNA高通量,然而目前很多病原体还很难在麻省理工学院的环境中都被培育越冬。

为了得到这些病原体的相关信息,学术研究技术人员采取了另另有一种方式,他们从环境中都(比如胃)查阅也就是说采样,随后在对整个采样中都的DNA进行时高通量,然后利用计算机方式对来自也就是说采样中都的数千种种群的族裔氨基酸进行时修缮,这种方式被称之为恒氨基酸学技术,该技术能作为一种替代方式对单个种群的DNA进行时复合和高通量。

学术系统地研究Rob Finn坚称,去年有数我们在内的三个独立自主一个团队修缮了已成千上万个胃化学物质三组氨基酸,而最大的问题就是这些一个团队所得到的结果确实具有可比性,以及确实能将这些结果概要已视为一个非常新一轮的清单。目前学术研究技术人员已经从进化胃中都有约4600种病原体群落中都概要了20万个氨基酸和1.7亿个蛋白质质氨基酸,这种新型的采样库(并存的进化胃胃氨基酸集合和并存的胃胃蛋白质质第一版)揭示了RX-胃的前所未见丰富性,并为进一步进行时胃化学物质三组学术研究开端了道路。

学术系统地研究插图出的这个前所未见的第一版是化学物质三组学术研究的一个历史性,将会或将能为科学界们共享非常可贵的森林资源来学术研究进化胃生态环境中都每一种病原体所担纲的关键因素配角。这项学术研究表明,有约70%被检测到的病原体从而在麻省理工学院中都被已成功培育过,而其在体内的活性仍然未知,而这类病原体中都最大的族裔就是Comantemales;学术系统地研究坚称,看到Comantemales如此尤其敢说一个惊喜,这就不言而喻了我们的确对胃中都的病原体大不相同,我希望这个第一版能尽力生物信息学家和免疫学家在将会几年弥补这一经验空白。

该采样库/第一版查阅的所有采样都能在的网站森林资源Mgnify中都得到,其能尽力科学界们量化化学物质的氨基酸采样并且与当前的采样库进行时对比;随着世界各地学术研究一个团队不断释出最初采样库,该第一版可能时会扩大到有数其它RX-各部位的化学物质三组,比如皮肤或口腔在表面上等各部位。就此学术系统地研究坚称,这一第一版的概要将会或为化学物质学家和临床学术研究技术人员共享非常丰富的森林资源,然而学术研究技术人员可能时会在南美洲、亚洲区和非洲等标志性严重不足的地区挖掘出不够多最初病原体种群,目前学术研究技术人员不一定可信不同人群中都病原体丰富性的差异和叠加持续性。

值得注意出处:

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.

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