Cell | 组织起来人类树突状细胞与辅助性T细胞相互作用模型

细胞内-细胞内强子极其有用，包含大量原子与频谱途径，学术界钻研多年，仍旧是管中的窥豹。来自德国科隆PSL深入研究学院的Vassili Soumelis团队于在CellMagazine上发表题为A Quantitative Multivariate Model of Human DendriticCell-T Helper Cell Communication的篇文章，组织起来了实验者与假说结合躯的深入研究方法有，实验者上，在RNA水平样品了细胞内所新陈代谢的细胞内因子与应激反应；假说上，组织起来了频谱输入驱动之间的联络和强子父子关系。写作者以全人类大脑皮质椭圆形细胞内（Dendritic cell，亦称DC）与发挥起到T细胞内（T Helper cell，亦称Th）之间的强子为深入研究普通人，分析了36亦然DC特别的频谱原子和17种Th新陈代谢的细胞内因子，并缺少这些数据资料组织起来数学假设，演算出56种已经被实验者属实的细胞内互为父子关系，与此同时，还推论出290种似乎父子关系，并属实了IL-12p70可以通过IL-1频谱途径起到于17型号发挥起到T细胞内（亦称Th17）。首先，写作者采集了全人类单核细胞内来源的DC（MoDCs）和外周血液CD11c+DC（bDCs）两类细胞内，并性刺激24小时。所采用的性刺激频谱主要包含三大类共计14种。第一种：内源频谱原子，仅限于干扰素beta（interferon β，亦称IFN-β），GM-CSF， TSLP和 PGE2；第二种：Toll样蛋白的配基，仅限于Toll4蛋白的-HT脂多糖（ lipopolysaccharide，亦称LPS），Toll1/2蛋白-HTPAM3CSK4，Dectin1-HTCurdlan，Toll2/Dectin1-HT zymosan，Toll7/8蛋白-HTR848，Toll3蛋白-HT poly(I：C) 和NLRP3炎症小躯活化剂铝钾；第三种：细菇病毒，仅限于干燥灭活的Candida albicans （亦称HKCA），李斯特菇（Listeria monocytogenes，亦称HKLM），Staphylococcus aureus （亦称HKSA）， Streptococcus pneumoniae （亦称HKSP）和流感病毒（influenza virus，亦称flu）。接下来，写作者通过流式细胞内术等方法有，样品了36种DC特别原子的表达椭圆形况，其中的，29种位处细胞内颗粒，7种位处细胞内新陈代谢上清之中的。近期，除了一些未知的DC细胞内叛离均，写作者还有了一些一新发掘出：（1）zymosan性刺激的MoDCs 表达多方面的CD54 和PVR；（2）流感病毒性刺激的MoDCs可以起到于ICOSL；（3）LPS性刺激的MoDCs 可以起到于多方面的CD30L和CD83。再下来，写作者将这些性刺激过的DC与T细胞内五小6天，随后样品Th的增殖高效率以及17种Th特别细胞内因子的表达新陈代谢椭圆形况。有趣的是，写作者将Th和DC的表现互为比较，发掘出，这彼此间并不不存在具躯来说的父子关系，也就是说，两种性刺激物对DC产生的视觉效果相同，但是，这两种性刺激物所处理的DC与T细胞内五小便，产生的视觉效果很可以截然不同。接着，写作者采用机器学习的方法有，以上述实验者数据资料组织起来假设。单纯来说，写作者区域性DC驱动的36种频谱原子和Th驱动的17种不稳定性原子，将两两之间的父子关系重构为“正向介导”和“对人介导”两种，并且，还自组数据资料库和已发表古书中的的信息，组织起来了有用的频谱介导互联网。亦然如，通过这一假设，写作者发掘出， IL-10的对人介导原子仅限于OX40L， 4-1BBL， IL-12， TNF-α， CD58， VISTA，Galectin-3， CD80， CD29， IL-1， ICAM-3， SLAMF3， IL-28a和CD83，而正向介导原子仅限于Jagged-2， PDL1， IL-10， CD11a， HLA-DR， ICOSL， CD100， CD30L， CD18， ICAM-2和CD86，这样，给与DC不同的性刺激频谱，写作者就可以揭示Th叛离细胞内IL-10的表达新陈代谢椭圆形况。最后，写作者并用这样假设，借此推论并属实一新细胞内互为父子关系。通过组织起来的假设，写作者发掘出，IL-12在与IL-1， ICAM-2或者Jagged-2联合新陈代谢时，个人主义于介导IL-17F，而与CD70， IL-23或者 LIGHT 联合出现时，则来得个人主义于介导IL-17A。另外，敲除IL-12，IL-17A和IL-17F的表达水平都显着减低。这些结果说明，IL-12参与Th17的起到于分立。为了进一步探讨IL-12起到于Th17的机制，写作者采用躯外起到于Th的假设，发掘出，IL-12并必须直接起到于Th17，但是，同时自组IL-1和IL-12，Th17就起到于出来了。这是一篇实验者与假说结合躯的经典作品。实验者结果与计算数学模型互为支持，互为聘请，总括。如下图示意图，实验者一小采用了密切关系关联两一小数据资料，一是何种性刺激下DC细胞内的叛离，二是叛离后的DC对T细胞内的起到。假说一小以DC和T细胞内的驱动细胞内因子为本躯，组织起来了细胞内因子之间的正向和对人介导互联网假设。通过这一假设，写作者众所周知一些一新细胞内间互为父子关系，事与愿违再用实验者属实这些父子关系否属实。这序言的亮点有两处，一是组织起来和实验者假说结合躯深入研究的范本，二是篇文章中的提供的诸多细胞内介导信息以供深入研究参看。原始出处：Grandclaudon M1, Perrot-Dockès M2, Trichot C1, et al.A Quantitative Multivariate Model of Human Dendritic Cell-T Helper Cell Communication.Cell. 2019 Oct 3;179(2):432-447.e21. doi: 10.1016/j.cell.2019.09.012.